2005 yılında, 454 Life Sciences ilk yeni nesil DNA dizileyiciyi piyasaya sürdü. DNA dizileme teknolojisinde böylece büyük bir ilerleme adımı atılmış oldu.

Kaynak: YourGenome
<http://www.yourgenome.org/facts/what-is-the-454-method-of-dna-sequencing>
- 454 yöntemi, tek bir günde bir milyar baza ulaşana eşdeğer DNA parçalarını dizileyebilir. Bu uzunluk, insan genomunun 1/3'ü kadardır.
- İnsan Genomu Projesi'nde DNA dizilemek için kullanılan yöntemlerden çok daha hızlı ve düşük maliyetlidir.
- Bununla birlikte, bu platformun da kendi zayıf yanları var. Özdeş bazların yinelemeli dizilerinde, ayırt etme güçlükleri olabiliyor.
454 DNA Dizileme Nasıl İşliyor?
- Süreç, çift sarmallı bir DNA örneği ile başlıyor.
- DNA, restrüksiyon enzimleri ile yaklaşık 400 ile 600 arasında değişen baz çiftlik parçalara ayrılıyor.
- Uyumlandırıcılar (İng. adaptors) olarak adlandırılan kısa DNA dizilimleri, bu DNA parçalarına ekleniyor.
- Karışıma küçük reçine boncukları katılıyor.
- Boncuklar üzerindeki DNA dizilimleri, uyumlandırıcıların üzerindekileri bütünleyici oluyor ve böylece DNA parçalarının doğrudan boncuklara bağlanması sağlanıyor.
- DNA parçaları boncukların üzerindeki DNA'lara bağlandığında, çift sarmalı bir arada tutan bağlar kırılıyor ve iplikler ayrılıyor. Tek iplikli DNA haline geliyorlar.
- Ardından DNA parçaları, polimeraz zincir tepkimesi olarak bilinen bir tepkime ile her boncuk üzerinde sayısız kez kopyalanıyor. Böylece DNA diziliminin milyonlarca özdeş kopyası oluşuyor.
- Sonra boncuklar filtre edilerek, herhangi bir DNA'ya bağlanamayanlar ya da birden fazla çeşit DNA parçası barındıranlar ayıklanıyor.
- Geriye kalan boncuklar, dizileme tepkimesi için gerekli olan DNA polimeraz ve primer içeren enzim boncuklarıyla birlikte, bir dizileme tabağındaki kuyulara konuyor; her kuyuda bir boncuk olacak biçimde.
- Polimeraz enzimi ve primer, boncuklardaki DNA parçalarına bağlanıyor.
- Nükleotit bazları, her seferinde bir çeşit baz olacak şekilde dalga dalga kuyulara ekleniyor.
- Herbir baz DNA ile birleştiğinde ışık tutularak kameraya alınıyor.
- Işığın yoğunluğu, yerleşen nükleotitlerle aynı türdekilerin sayısına denk geliyor. Örneğin eğer ard arda üç A dizide bulunuyorsa, üretilen ışık tek A içeren parçadan üç katı oluyor.
- Işık yoğunluğunun deseni çizilerek, orijinal DNA parçasındaki dizilim çözülebiliyor.

Kaynak: YourGenome
<http://www.yourgenome.org/facts/what-is-the-454-method-of-dna-sequencing>
Bu içerik BilimFili.com yazarı tarafından oluşturulmuştur. BilimFili.com`un belirtmiş olduğu “Kullanım İzinleri”ne bağlı kalmak kaydıyla kullanabilirsiniz.
Kaynak ve İleri Okuma
Etiket
Projelerimizde bize destek olmak ister misiniz?
Dilediğiniz miktarda aylık veya tek seferlik bağış yapabilirsiniz.
Destek Ol
Yorum Yap (0)
Bunlar da İlginizi Çekebilir

27 Haziran 2019
Kromozom Haritaları: Idiogramlar

23 Aralık 2016
Newton'un "Başına Düşen" Elmanın Genomu Dizileniyor

20 Aralık 2018
Filogenetik Yöntemler SEOA'nın Yaşamına Işık Tutuyor

04 Haziran 2016
En Temel Ölçekte Evrim: Amino Asit Sıra Değişimleri

27 Ocak 2015
Meraklısına Doku-bazlı İnsan Proteom Haritası

11 Haziran 2015
Yakın Akrabamız Bonobonun Genom Dizilimi Tamamlandı

30 Ağustos 2017
"Çöp DNA'lar" Embriyo Gelişiminde Kilit Role Sahip